2023年12月6日，空間多組學(xué)被Nature Methods雜志評(píng)選為2023年度最值得期待的技術(shù)之一，是繼2022年被Nature雜志稱為最值得期待的技術(shù)之一后再獲年度殊榮！
圖 1. Nature Method文章截圖
隨著生物體發(fā)展進(jìn)化過程，空間信息的缺乏往往使得單個(gè)細(xì)胞在組織中如何執(zhí)行功能無法被揭示，因此分析胞內(nèi)的功能狀態(tài)對胞外及周圍環(huán)境顯得格外必要。先進(jìn)的空間多組學(xué)可以幫助識(shí)別新的細(xì)胞亞型，局部觀察細(xì)胞內(nèi)和細(xì)胞間分子相互作用。從染色質(zhì)到表型，從DNA到代謝，多組學(xué)方法旨在聯(lián)合基因組、表觀組、蛋白質(zhì)組及代謝組的信息，拓寬我們對機(jī)制關(guān)系的認(rèn)識(shí)，揭示細(xì)胞功能所必需的分子作用，構(gòu)建可持續(xù)發(fā)展的疾病精準(zhǔn)醫(yī)療方案。
空間多組學(xué)技術(shù)全面助力人類組織圖譜解析
今年 6 月份，Nature發(fā)布迄今為止最詳細(xì)、最全面的人類乳腺細(xì)胞圖譜，空間多組學(xué)技術(shù)全面助力人類組織圖譜解析。研究利用單細(xì)胞/單核/空間轉(zhuǎn)錄組和多重免疫組化（mIHC）技術(shù)鑒定出人類 12 種主要的細(xì)胞類型，描繪 58 種不同的細(xì)胞狀態(tài)，并對具體的細(xì)胞類型和細(xì)胞間的相互作用進(jìn)一步解析，詳細(xì)描繪乳腺組織中各細(xì)胞亞型的細(xì)胞狀態(tài)和空間聯(lián)絡(luò)，為深入理解乳腺組織的解剖生物學(xué)特征和疾病治療提供全面的理論依據(jù)。
圖 2.乳腺組織中主要細(xì)胞類型的空間組學(xué)分析
艾克發(fā)生物mIHC和RNA-ISH強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合
RNA 和蛋白的空間分布對于確定蛋白質(zhì)在組織中的準(zhǔn)確定位和功能至關(guān)重要，其可隨著細(xì)胞類型、細(xì)胞周期進(jìn)展、疾病狀態(tài)和診療方法的變化而改變。通過不同組學(xué)實(shí)現(xiàn)生物標(biāo)志物與空間位置的一一對應(yīng)，獲得更高維度和更高分辨率的表達(dá)圖譜，全面解析組織微環(huán)境，以便提供精確診斷和治療的方案。
艾克發(fā)生物于12月初推出AlphaXISH® 新一代RNA 原位雜交試劑盒后，升級(jí)mIHC方案，實(shí)現(xiàn) mIHC和RNA-ISH兩大技術(shù)強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合，可在同一張切片上可同時(shí)獲得 RNA 和蛋白水平的原位信息，單細(xì)胞分辨率下檢測、表征和分析，獲得真正的空間多組學(xué)信息，詳細(xì)展示細(xì)胞鄰域和組織微環(huán)境，在真實(shí)的組織空間背景下深入洞察細(xì)胞間相互作用、細(xì)胞通訊和細(xì)胞狀態(tài)，發(fā)現(xiàn)有關(guān)腫瘤問題的關(guān)鍵機(jī)制，從而實(shí)現(xiàn)在臨床上的大規(guī)模應(yīng)用。
該方案可應(yīng)用于腫瘤免疫、神經(jīng)科學(xué)、細(xì)胞和基因治療、傳染病、炎癥等領(lǐng)域，檢測靶細(xì)胞中的非編碼 RNA，識(shí)別分泌蛋白的細(xì)胞來源，檢測特定細(xì)胞的高度同源轉(zhuǎn)錄本、可變剪接體等，進(jìn)行RNA-蛋白表達(dá)相關(guān)性分析等。
圖3. 單細(xì)胞原位空間多組學(xué)整體解決方案
圖 4. RNA 雙標(biāo) + 蛋白三標(biāo)共染視野圖
